ประสิทธิภาพของชุดตรวจขยายกรดนิวคลีอิกสี่ชุดเพื่อระบุ SARS-CoV-2 ในเอธิโอเปีย

ขอขอบคุณที่เยี่ยมชม Nature.com คุณกำลังใช้เวอร์ชันเบราว์เซอร์ที่มีการรองรับ CSS แบบจำกัด เพื่อประสบการณ์ที่ดีที่สุด เราขอแนะนำให้คุณใช้เบราว์เซอร์ที่อัปเดต (หรือปิดใช้งานโหมดความเข้ากันได้ใน Internet Explorer) นอกจากนี้ เพื่อให้มั่นใจว่าได้รับการสนับสนุนอย่างต่อเนื่อง เราจะแสดงไซต์โดยไม่มีสไตล์และ JavaScript
แสดงภาพหมุนสามสไลด์พร้อมกัน ใช้ปุ่มก่อนหน้าและถัดไปเพื่อเลื่อนผ่านสามสไลด์ในแต่ละครั้ง หรือใช้ปุ่มแถบเลื่อนที่ส่วนท้ายเพื่อเลื่อนผ่านสามสไลด์ในแต่ละครั้ง
นับตั้งแต่เกิดการระบาดของโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา (โควิด-19) ในปี 2019 การทดสอบการขยายกรดนิวคลีอิก (NAAT) เชิงพาณิชย์จำนวนมากได้รับการพัฒนาทั่วโลกและได้กลายเป็นการตรวจมาตรฐาน แม้ว่าการทดสอบหลายอย่างจะได้รับการพัฒนาอย่างรวดเร็วและนำไปใช้กับการทดสอบวินิจฉัยในห้องปฏิบัติการ แต่ประสิทธิภาพของการทดสอบเหล่านี้ยังไม่ได้รับการประเมินในสภาพแวดล้อมที่หลากหลาย ดังนั้น การศึกษานี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินประสิทธิภาพของชุดตรวจ SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI และ Sansure Biotech ของ Abbott โดยใช้ Composite Reference Standard (CRS) การศึกษานี้ดำเนินการที่สถาบันสาธารณสุขแห่งเอธิโอเปีย (EPHI) ตั้งแต่วันที่ 1 ถึง 30 ธันวาคม 2020 โดยสกัดตัวอย่างโพรงหลังจมูก 164 ตัวอย่างโดยใช้ชุดมินิ QIAamp RNA และระบบการเตรียมตัวอย่าง DNA ของ Abbott จากตัวอย่าง 164 ตัวอย่าง 59.1% เป็นบวกและ 40.9% เป็นลบสำหรับ CRS ผลเชิงบวกของ Sansure Biotech ต่ำอย่างมีนัยสำคัญเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.05) ผลเชิงบวกของ Sansure Biotech ต่ำอย่างมีนัยสำคัญเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.05) Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p < 0,05) ผลลัพธ์เชิงบวกของ Sansure Biotech ต่ำกว่าอย่างมีนัยสำคัญเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.05)ที่ CRS 相比,Sansure Biotech ของ Sansure 阳性率显着较低（p < 0.05）。ที่ CRS 相比,Sansure Biotech ของ Sansure 阳性率显着较低（p < 0.05）。 У Sansure Biotech было значительно меньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05) Sansure Biotech ให้ผลลัพธ์เชิงบวกน้อยกว่าอย่างมีนัยสำคัญเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.05)ข้อตกลงโดยรวมของการวิเคราะห์ทั้งสี่ครั้งคือ 96.3–100% เมื่อเทียบกับ CRS นอกจากอัตราบวกที่ต่ำของชุดตรวจ Sansure Biotech แล้ว ประสิทธิภาพของชุดตรวจทั้ง 4 ชุดยังแทบจะเทียบเคียงกันได้ ด้วยเหตุนี้ การทดสอบ Sansure Biotech [การวิจัยเท่านั้น (RUO)] จึงจำเป็นต้องมีการตรวจสอบเพิ่มเติมสำหรับการใช้งานในเอธิโอเปีย สุดท้ายนี้ ควรพิจารณาการวิจัยเพิ่มเติมเพื่อประเมินการทดสอบตามข้อกล่าวอ้างของผู้ผลิตที่เหมาะสม
การทดสอบในห้องปฏิบัติการเป็นส่วนหนึ่งของแผนยุทธศาสตร์การเตรียมความพร้อมและการตอบสนอง (SPRP) ขององค์การอนามัยโลก (WHO) สำหรับโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 (โควิด-19) WHO แนะนำว่าประเทศต่างๆ จำเป็นต้องสร้างขีดความสามารถของห้องปฏิบัติการเพื่อปรับปรุงการเตรียมพร้อม การจัดการรายกรณีที่เหมาะสม การเฝ้าระวัง และการตอบสนองต่อความท้าทายด้านสาธารณสุขอย่างรวดเร็ว สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าบทบาทของห้องปฏิบัติการเป็นกุญแจสำคัญในการระบุลักษณะโรคและระบาดวิทยาของเชื้อโรคที่เกิดขึ้นใหม่และการควบคุมการแพร่กระจาย
การวินิจฉัยโรคโควิด-19 ต้องใช้ข้อมูลทางระบาดวิทยาและการแพทย์ อาการ/สัญญาณส่วนบุคคล และข้อมูลทางรังสีและห้องปฏิบัติการ2 เนื่องจากมีรายงานการระบาดของโควิด-19 ในหวู่ฮั่น ประเทศจีน จึงมีการพัฒนาการทดสอบการขยายกรดนิวคลีอิกเชิงพาณิชย์ (NAAT) จำนวนมากทั่วโลก ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสจากการถอดรหัสย้อนกลับแบบเรียลไทม์ (rRT-PCR) ถูกนำมาใช้เป็นวิธีปกติและเป็นมาตรฐานสำหรับการวินิจฉัยทางห้องปฏิบัติการเกี่ยวกับการติดเชื้อทางเดินหายใจเฉียบพลันรุนแรง 2 (SARS-CoV-2)3 การตรวจหาระดับโมเลกุลของ SARS-CoV-2 โดยทั่วไปจะขึ้นอยู่กับยีน N (ยีนโปรตีนนิวคลีโอแคปซิด), E (ยีนโปรตีนแบบห่อหุ้ม) และยีน RdRp (ยีน RNA polymerase ที่ขึ้นกับ RNA) ใน ORF1a/b (กรอบการอ่านแบบเปิด 1a/b) . ยีน) บริเวณที่ระบุได้จากจีโนมของไวรัส พวกมันถือเป็นพื้นที่อนุรักษ์หลักที่พบในจีโนมของไวรัสเพื่อการจดจำไวรัส ในบรรดายีนเหล่านี้ ยีน RdRp และ E มีความไวในการตรวจจับเชิงวิเคราะห์สูง ในขณะที่ยีน N มีความไวในการวิเคราะห์ต่ำ
ประสิทธิภาพของการตรวจ PCR อาจแตกต่างกันไปขึ้นอยู่กับปัจจัยต่างๆ เช่น รีเอเจนต์ในการสกัด รีเอเจนต์สำหรับการขยาย/การตรวจจับ วิธีการสกัด คุณภาพของเครื่อง PCR และเครื่องมืออื่นๆ ในเดือนเมษายน 2020 อุปกรณ์วินิจฉัยมากกว่า 48 เครื่องจาก 9 ประเทศได้รับการอนุมัติการใช้ในกรณีฉุกเฉิน (EUA) สำหรับการวินิจฉัยโรคโควิด-196 ในเอธิโอเปีย มีการใช้แพลตฟอร์ม PCR แบบเรียลไทม์มากกว่า 14 แพลตฟอร์มในการตรวจหา PCR ของ SARS-CoV-2 ที่สถาบันสาธารณสุข 26 แห่ง รวมถึง ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 และ Quant-studio7 นอกจากนี้ ยังมีชุดทดสอบ PCR หลายแบบให้เลือก เช่น การทดสอบ Daan Gene, การทดสอบ Abbott SARS-CoV-2, การทดสอบ Sansure Biotech และการทดสอบ SARS-CoV-2 BGI แม้ว่า rRT-PCR จะมีความไวสูง แต่ผู้ป่วยบางรายที่ติดเชื้อโควิด-19 รายงานผลลบลวง เนื่องจากมีสำเนาของกรดไรโบนิวคลีอิกของไวรัส (RNA) ไม่เพียงพอในตัวอย่างที่เกิดจากการเก็บรวบรวม การขนส่ง การจัดเก็บ และการจัดการที่ไม่เหมาะสม และการทดสอบในห้องปฏิบัติการ เงื่อนไขและการกระทำของบุคลากร8. นอกจากนี้ การจัดการตัวอย่างหรือการควบคุมที่ไม่ถูกต้อง การตั้งค่าขีดจำกัดรอบ (Ct) และปฏิกิริยาข้ามกับกรดนิวคลีอิกที่ทำให้เกิดโรคอื่นๆ หรือ SARS-CoV-2 RNA ที่ไม่ใช้งาน/ตกค้าง สามารถนำไปสู่ผลลัพธ์เชิงบวกที่ผิดพลาดในการตรวจวิเคราะห์ rRT-PCR9 ดังนั้นจึงชัดเจนว่าการทดสอบ PCR สามารถระบุพาหะของชิ้นส่วนของยีนได้จริง เนื่องจากไม่สามารถแยกแยะระหว่างยีนของไวรัสที่มีฤทธิ์อย่างแท้จริงได้ ดังนั้นการทดสอบจึงสามารถระบุได้เฉพาะพาหะเท่านั้น ไม่ใช่ผู้ป่วย10 ดังนั้นจึงเป็นเรื่องสำคัญที่จะต้องประเมินประสิทธิภาพการวินิจฉัยโดยใช้วิธีมาตรฐานในการตั้งค่าของเรา แม้ว่ารีเอเจนต์ NAAT จำนวนมากมีจำหน่ายที่สถาบันสาธารณสุขแห่งเอธิโอเปีย (EPHI) และทั่วประเทศ แต่ยังไม่มีรายงานการประเมินประสิทธิผลเชิงเปรียบเทียบ ดังนั้น การศึกษานี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินประสิทธิภาพเปรียบเทียบของชุดอุปกรณ์ที่มีจำหน่ายทั่วไปสำหรับการตรวจหา SARS-CoV-2 ด้วย rRT-PCR โดยใช้ตัวอย่างทางคลินิก
มีผู้เข้าร่วมที่สงสัยว่าเป็นโรคโควิด-19 ทั้งหมด 164 รายรวมอยู่ในการศึกษานี้ กลุ่มตัวอย่างส่วนใหญ่มาจากศูนย์บำบัด (118/164 = 72%) ในขณะที่ผู้เข้าร่วม 46 รายที่เหลือ (28%) มาจากศูนย์ที่ไม่ใช่ศูนย์บำบัด ในบรรดาผู้เข้าร่วมที่ไม่ได้รับการรักษาที่ศูนย์ มี 15 ราย (9.1%) มีอาการต้องสงสัยทางคลินิก และ 31 ราย (18.9%) มีการติดต่อกับผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน ผู้เข้าร่วมเก้าสิบสามคน (56.7%) เป็นชาย และอายุเฉลี่ย (± SD) ของผู้เข้าร่วมคือ 31.10 (± 11.82) ปี
ในการศึกษานี้ ได้กำหนดอัตราบวกและลบของการตรวจหาเชื้อโควิด-19 จำนวน 4 รายการ ดังนั้น อัตราบวกของการทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott, การทดสอบ Daan Gene 2019-nCoV, การทดสอบ SARS-CoV-2 BGI และการทดสอบ Sansure Biotech 2019-nCoV อยู่ที่ 59.1%, 58.5%, 57.9% และ 55.5% ตามลำดับ . คะแนนมาตรฐานอ้างอิงคอมโพสิต (CRS) เชิงบวกและเชิงลบคือ 97 (59.1%) และ 67 (40.9%) ตามลำดับ (ตารางที่ 1) ในการศึกษานี้ คำจำกัดความของ CRS อยู่บนพื้นฐานของกฎ "ผลบวกใดๆ" โดยที่ผลการทดสอบจากสี่รายการ ผลการทดสอบสองรายการขึ้นไปที่ให้ผลลัพธ์เดียวกันจะถือว่าเป็นผลบวกหรือลบจริง
ในการศึกษานี้ เราพบข้อตกลงเปอร์เซ็นต์เชิงลบ (NPA) 100% (95% CI 94.6–100) สำหรับการวิเคราะห์ทั้งหมดเมื่อเปรียบเทียบกับ CRS การวิเคราะห์เทคโนโลยีชีวภาพของ Sansure แสดงให้เห็น PPA ขั้นต่ำที่ 93.8% (95% CI 87.2-97.1) และการวิเคราะห์ Daan Gene 2019-nCoV มีข้อตกลงโดยรวมที่ 99.4% (95% CI 96.6-99.9) ในทางตรงกันข้าม ข้อตกลงโดยรวมระหว่างการทดสอบ SARS-CoV-2 BGI และการทดสอบ Sansure Biotech 2019-nCoV อยู่ที่ 98.8% และ 96.3% ตามลำดับ (ตารางที่ 2)
ค่าสัมประสิทธิ์คัปปาของโคเฮนระหว่างผลการทดสอบ CRS และ Abbott SARS-CoV-2 มีความสอดคล้องกันโดยสมบูรณ์ (K = 1.00) ในทำนองเดียวกัน ค่าคัปปาของโคเฮนที่ตรวจพบโดย Daan Gene 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI และ Sansure Biotech 2019-nCoV ก็สอดคล้องกับ CRS อย่างสมบูรณ์เช่นกัน (K ≥ 0.925) ในการวิเคราะห์เปรียบเทียบนี้ การทดสอบไคสแควร์ (การทดสอบ McNemar) แสดงให้เห็นว่าผลการทดสอบ Sansure Biotech 2019-nCoV แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญจากผลลัพธ์ CRS (p = 0.031) (ตารางที่ 2)
ดังแสดงในรูป1 เปอร์เซ็นต์ของค่า Ct ต่ำสุด (< 20 Ct) ของการทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott (ยีน RdRp และ N รวม) อยู่ที่ 87.6% และค่า Ct ของยีน ORF1a/b ของการทดสอบ Sansure Biotech 2019-nCoV แสดงให้เห็นว่าเปอร์เซ็นต์ของค่า Ct ของยีนต่ำ ค่า Ct (< 20 Ct) คือ 50.3% และค่า Ct สูง (36–40 Ct) คือ 3.2% 1 เปอร์เซ็นต์ของค่า Ct ต่ำสุด (< 20 Ct) ของการทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott (ยีน RdRp และ N รวม) อยู่ที่ 87.6% และค่า Ct ของยีน ORF1a/b ของการทดสอบ Sansure Biotech 2019-nCoV แสดงให้เห็นว่าเปอร์เซ็นต์ของค่า Ct ของยีนต่ำ ค่า Ct (< 20 Ct) คือ 50.3% และค่า Ct สูง (36–40 Ct) คือ 3.2%ดังแสดงในรูป1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) และ Abbott SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало что процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3%, а высокое значение Ct (36–40 Ct) ปริมาณสาร 3.2% ในรูปที่ 1 เปอร์เซ็นต์ของการวิเคราะห์ค่า Ct ต่ำสุด (< 20 Ct) ของ Abbott SARS-CoV-2 (ยีน RdRp และ N แบบรวม) อยู่ที่ 87.6% และค่า Ct ของการวิเคราะห์ยีน ORF1a/b ของ Sansure Biotech 2019-nCoV แสดงให้เห็น เปอร์เซ็นต์ของค่า Ct ต่ำ (< 20 Ct) คิดเป็น 50.3% และค่า Ct สูง (36–40 Ct) คิดเป็น 3.2%如示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（< 20 Ct）为87.6%，Sansure Biotech 2019-nCoV检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%，高Ct 值(36–40 Ct) 的百分比为3.2%。 ดังที่แสดงในรูปที่ 1 เปอร์เซ็นต์ค่า Ct ต่ำสุด (< 20 Ct) ของการทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott (การรวมกันของยีน RdRp และ N) คือ 87.6% ค่า Ct ของยีน ORF1a/b ของการทดสอบ Sansure Biotech 2019-nCoV แสดง Ct ต่ำ (< 20 Ct) ของเปอร์เซ็นต์คือ 50.3%, 高Ct เปอร์เซ็นต์ (36–40 Ct) คือ 3.2% Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое процентное значение Ct (< 20 Ct) ใน размере 87.6%, และ Ct гена ORF1a/b ใน исследовании Sansure Biotech 2019- Анализ nCoV показал низкий Ct. ดังที่แสดงในรูปที่ 1 การทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott (รวมยีน RdRp และ N) มีค่า Ct เปอร์เซ็นต์ต่ำสุด (< 20 Ct) ที่ 87.6% ในขณะที่ค่า Ct ของยีน ORF1a/b ใน Sansure การศึกษาเทคโนโลยีชีวภาพปี 2019 – การวิเคราะห์ nCoV พบว่ามีค่า Ct ต่ำ ส่วนผสม значений (< 20 Ct) ส่วนผสม 50.3%, ส่วนผสม значений Ct (36–40 Ct) ส่วนผสม 3.2% เปอร์เซ็นต์ของค่า (< 20 Ct) คือ 50.3% และเปอร์เซ็นต์ของค่า Ct สูง (36–40 Ct) คือ 3.2%ผลการทดสอบ SARS-CoV-2 B ของ Abbott บันทึกค่า Ct สูงกว่า 30 ในทางกลับกัน ในการทดสอบ BGI SARS-CoV-2 ยีน ORF1a/b มีค่า Ct สูง (> 36 Ct) เปอร์เซ็นต์คือ 4% (รูปที่ 1) ในทางกลับกัน ในการทดสอบ BGI SARS-CoV-2 ยีน ORF1a/b มีค่า Ct สูง (> 36 Ct) เปอร์เซ็นต์คือ 4% (รูปที่ 1) С другой стороны, анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составлял 4% (рис. 1). ในทางกลับกัน ในการวิเคราะห์ยีน BGI SARS-CoV-2 ORF1a/b มีค่า Ct สูง (> 36 Ct) โดยมีเปอร์เซ็นต์อยู่ที่ 4% (รูปที่ 1)另一方的BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比为4%（จิน1）。 ในทางกลับกัน ในการตรวจจับ BGI SARS-CoV-2 เปอร์เซ็นต์ของยีน ORF1a/b ที่มีค่า Ct สูง (>36 Ct) คือ 4% (รูปที่ 1) С другой стороны, анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (рис. 1). ในทางกลับกัน ในการวิเคราะห์ BGI SARS-CoV-2 เปอร์เซ็นต์ของยีน ORF1a/b ที่มีค่า Ct สูง (>36 Ct) คือ 4% (รูปที่ 1)
ในการศึกษานี้ เราได้เก็บตัวอย่างโพรงหลังจมูกจำนวน 164 ตัวอย่าง สำหรับการตรวจวิเคราะห์ทุกประเภท การแยกและการขยาย RNA ดำเนินการโดยใช้วิธีการและชุดอุปกรณ์ที่แนะนำโดยผู้ผลิตที่เกี่ยวข้อง
การศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าการทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott มีประสิทธิภาพการตรวจจับเช่นเดียวกับ CRS โดยมีความสอดคล้องทั้งเชิงบวก ลบ และโดยรวม 100% ข้อตกลงคัปปาของโคเฮนคือ 1.00 ซึ่งแสดงถึงข้อตกลงฉบับสมบูรณ์กับ CRS การศึกษาที่คล้ายกันโดยมหาวิทยาลัยวอชิงตันในสหรัฐอเมริกา พบว่าความไวและความจำเพาะโดยรวมของการทดสอบของ Abbott สำหรับ SARS-CoV-2 อยู่ที่ 93% และ 100% ตามลำดับ เมื่อเปรียบเทียบกับการทดสอบที่กำหนดโดยห้องปฏิบัติการ (LDA) ของ CDC . 11. ระบบการตรวจจับ SARS-CoV-2 ของ Abbott อาศัยการตรวจจับยีน N และ RdRp พร้อมกัน เนื่องจากยีนทั้งสองมีความไวมากกว่า โดยลดผลลบลวง12 การศึกษาในกรุงเวียนนา ประเทศออสเตรีย ยังแสดงให้เห็นว่าปริมาณตัวอย่างการสกัดขนาดใหญ่และปริมาตรตัวชะสำหรับการตรวจจับช่วยลดผลกระทบจากการเจือจางและเพิ่มประสิทธิภาพในการตรวจจับ13 ดังนั้น การจับคู่ที่สมบูรณ์แบบของแอ๊บบอตสำหรับการทดสอบ SARS-CoV-2 จึงสามารถเชื่อมโยงกับระบบการตรวจจับแพลตฟอร์มที่ตรวจจับยีนเชิงผสมไปพร้อมๆ กัน สกัดตัวอย่างจำนวนมาก (0.5 มล.) และใช้สารชะจำนวนมาก (40 ไมโครลิตร)
ผลลัพธ์ของเรายังแสดงให้เห็นว่าประสิทธิภาพการตรวจจับของการทดสอบทางพันธุกรรม Daan นั้นเกือบจะเหมือนกับของ CRS ซึ่งสอดคล้องกับการศึกษาวิจัย14 ที่มหาวิทยาลัยอันฮุยในเมืองหวยหนาน ประเทศจีน และการกล่าวอ้างของผู้ผลิตว่ามีข้อตกลงเชิงบวก 100% แม้จะมีรายงานผลลัพธ์ที่สอดคล้องกัน แต่มีตัวอย่างหนึ่งที่ให้ผลลบลวงหลังจากทดสอบสารชะล้างเดียวกันซ้ำ แต่กลับเป็นบวกในการตรวจวิเคราะห์ SARS-CoV-2 ของ Abbott และ Sansure Biotech nCoV-2019 สิ่งนี้ชี้ให้เห็นว่าผลลัพธ์อาจมีความแปรปรวนในการตรวจวิเคราะห์ประเภทต่างๆ อย่างไรก็ตาม ในการศึกษาที่ดำเนินการในประเทศจีน ผลลัพธ์ของการทดสอบ Daan Gene มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p <0.05) เมื่อเปรียบเทียบกับการทดสอบอ้างอิงที่กำหนดโดยห้องปฏิบัติการ อย่างไรก็ตาม ในการศึกษาที่ดำเนินการในประเทศจีน ผลลัพธ์ของการทดสอบ Daan Gene มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p <0.05) เมื่อเปรียบเทียบกับการทดสอบอ้างอิงที่กำหนดโดยห้องปฏิบัติการ Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от их лабораторного эталонного анализа. อย่างไรก็ตาม ในการศึกษาในประเทศจีน15 ผลการวิเคราะห์ของ Daan Gene แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p < 0.05) จากการวิเคราะห์อ้างอิงในห้องปฏิบัติการ然而，其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p < 0.05）。然而，其实验室定义的参考检测相比มี显着差 <0.05 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Daan значительно отличались (p < 0,05) по сравнению с его эталонным лабораторным тестом. อย่างไรก็ตาม ในการศึกษาในประเทศจีน15 ผลลัพธ์ของการทดสอบทางพันธุกรรมของต้าอันแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ (p < 0.05) เมื่อเปรียบเทียบกับการทดสอบในห้องปฏิบัติการอ้างอิงความคลาดเคลื่อนนี้อาจเกิดจากความไวของการทดสอบอ้างอิงเพื่อตรวจหา SARS-CoV-2 และการศึกษาเพิ่มเติมอาจมีความสำคัญในการระบุสาเหตุ
นอกจากนี้ การศึกษาของเราได้ประเมินประสิทธิภาพเชิงเปรียบเทียบของการทดสอบ SARS-CoV-2 BGI กับ CRS ซึ่งแสดงข้อตกลงเปอร์เซ็นต์เชิงบวกที่ยอดเยี่ยม (PPA = 97.9%) เปอร์เซ็นต์ข้อตกลงที่เป็นลบ (NPA = 100%) และเปอร์เซ็นต์ข้อตกลงโดยรวมตามเพศ ( โอป้า) - = 98.8%). ค่าคัปปาของโคเฮนแสดงให้เห็นข้อตกลงที่ดี (K = 0.975) การศึกษาในประเทศเนเธอร์แลนด์16 และจีน15 แสดงให้เห็นผลลัพธ์ที่สอดคล้องกัน การทดสอบ SARS-CoV-2 BGI เป็นการทดสอบการตรวจจับยีนเดี่ยว (ORF1a/b) โดยใช้ตัวชะขยาย/การตรวจจับ 10 µl แม้จะมีข้อตกลงทางสถิติที่ดีกับผลการอ้างอิงของเรา แต่การวิเคราะห์ก็พลาดตัวอย่างที่เป็นบวกสองตัวอย่าง (1.22%) ของกลุ่มตัวอย่างทั้งหมด สิ่งนี้อาจมีผลกระทบทางคลินิกอย่างมากต่อการเปลี่ยนแปลงของการแพร่เชื้อทั้งในระดับผู้ป่วยและชุมชน
การวิเคราะห์เปรียบเทียบอีกรายการหนึ่งที่รวมอยู่ในการศึกษานี้คือการทดสอบ Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) เปอร์เซ็นต์การจับคู่โดยรวมคือ 96.3% ความเข้มแข็งของข้อตกลงยังถูกกำหนดโดยค่าคัปปาของโคเฮน ซึ่งเท่ากับ 0.925 ซึ่งบ่งชี้ถึงข้อตกลงโดยสมบูรณ์กับ CRS ขอย้ำอีกครั้ง ผลลัพธ์ของเราเหมือนกับการศึกษาที่ Central South University ในเมืองฉางซา ประเทศจีน และที่แผนกห้องปฏิบัติการทางคลินิกของโรงพยาบาลประชาชน Liuzhou เมือง Liuzhou ประเทศจีน17 แม้ว่าจะมีการบันทึกความสอดคล้องทางสถิติที่ดีข้างต้นแล้ว แต่การทดสอบไคสแควร์ (การทดสอบ MacNemar) แสดงให้เห็นว่าผลลัพธ์ของการทดสอบ Sansure Biotech มีความแตกต่างที่มีนัยสำคัญทางสถิติเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.005) แม้ว่าจะมีการบันทึกความสอดคล้องทางสถิติที่ดีข้างต้นแล้ว แต่การทดสอบไคสแควร์ (การทดสอบ MacNemar) แสดงให้เห็นว่าผลลัพธ์ของการทดสอบ Sansure Biotech มีความแตกต่างที่มีนัยสำคัญทางสถิติเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.005) Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал, что результат анализа Sansure Biotech имеет статистически значимое различие по сравнению с CRS (p < 0,005) แม้ว่าข้อตกลงทางสถิติที่ดีข้างต้นจะได้รับการบันทึกไว้ แต่การทดสอบไคสแควร์ (การทดสอบ McNemar) แสดงให้เห็นว่าผลลัพธ์ของการทดสอบ Sansure Biotech มีความแตกต่างที่มีนัยสำคัญทางสถิติเมื่อเปรียบเทียบกับ CRS (p < 0.005)尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech 检测的结果与CRS相比具有统计学显着差异（p < 0.005）。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 ， 但 检验 （（macnemar 检验 表明 ， ， sansure biotech 检测 结果 与 crs 相比具有 显着 （（p <0.005。。。。。。。。。。。。。。。。。。。）））) Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Макнемара) показал статистически значимую разницу (p < 0,005) между анализом Sansure Biotech и CRS. แม้จะมีข้อตกลงทางสถิติที่ดีที่ระบุไว้ข้างต้น แต่การทดสอบไคสแควร์ (การทดสอบ McNemar) แสดงให้เห็นถึงความแตกต่างที่มีนัยสำคัญทางสถิติ (p < 0.005) ระหว่างการทดสอบ Sansure Biotech และ CRSพบว่าหกตัวอย่าง (3.66%) เป็นผลลบลวงเมื่อเปรียบเทียบกับ CRS (ตารางเสริม 1); สิ่งนี้สำคัญมาก โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อพิจารณาถึงการเปลี่ยนแปลงของการแพร่เชื้อไวรัส ข้อมูลข้างต้นยังสนับสนุนอัตราการตรวจจับที่ต่ำนี้15
ในการศึกษานี้ ค่า Ct ถูกกำหนดไว้สำหรับการทดสอบแต่ละครั้งและแต่ละแพลตฟอร์ม โดยค่า Ct เฉลี่ยต่ำสุดที่รายงานในการทดสอบ Abbott SARS-CoV-2 ผลลัพธ์นี้อาจเกี่ยวข้องกับระบบการทดสอบทางพันธุกรรมแบบผสมผสานพร้อมกันของแอ๊บบอตสำหรับการตรวจหา SARS-CoV-2 ดังนั้น ตามรูปที่ 1 ผลการตรวจ SARS-CoV-2 ของ Abbott ร้อยละ 87.6 มีค่า Ct ต่ำกว่า 20 ผลการตรวจตัวอย่างเพียงเล็กน้อย (12.4%) เท่านั้นที่อยู่ในช่วง 20-30 ไม่ได้บันทึกค่า Ct ที่สูงกว่า 30 นอกจากการใช้รูปแบบการทดสอบทางพันธุกรรมแผง SARS-CoV-2 ของแอ๊บบอตแล้ว ผลลัพธ์นี้อาจเกี่ยวข้องกับขีดจำกัดการตรวจจับขั้นต่ำ (32.5 สำเนา RNA/มิลลิลิตร)18 ซึ่งต่ำกว่าขีดจำกัดล่างของบริษัทที่จำกัด 100 สำเนา RNA ถึง 3 เท่า /มล. มล.)19.
การศึกษานี้มีข้อจำกัดบางประการ: ประการแรก เราไม่มีวิธีมาตรฐาน/อ้างอิง [เช่น ปริมาณไวรัสหรือการทดสอบในห้องปฏิบัติการอื่น (LDA)] เนื่องจากขาดทรัพยากร ประการที่สอง ตัวอย่างทั้งหมดที่ใช้ในการศึกษานี้เป็นผ้าเช็ดโพรงจมูก ในขณะที่ผลลัพธ์ไม่สามารถใช้ได้กับตัวอย่างประเภทอื่น และประการที่สาม ขนาดตัวอย่างของเรามีขนาดเล็ก
การศึกษานี้เปรียบเทียบประสิทธิภาพของชุดตรวจ rRT-PCR จำนวน 4 ชุดสำหรับ SARS-CoV-2 โดยใช้ตัวอย่างช่องจมูก การทดสอบการตรวจจับทั้งหมดมีประสิทธิภาพใกล้เคียงกัน ยกเว้นการทดสอบ Sansure Biotech นอกจากนี้ อัตราผลบวกที่ต่ำยังถูกระบุในการทดสอบ Sansure Biotech เมื่อเปรียบเทียบกับ CRS (p < 0.05) นอกจากนี้ อัตราผลบวกที่ต่ำยังถูกระบุในการทดสอบ Sansure Biotech เมื่อเปรียบเทียบกับ CRS (p < 0.05) Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). นอกจากนี้ การทดสอบของ Sansure Biotech ยังแสดงเปอร์เซ็นต์ผลลัพธ์เชิงบวกที่ต่ำเมื่อเทียบกับ CRS (p < 0.05)此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p < 0.05)。此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p < 0.05)。 Кроме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). นอกจากนี้ การทดสอบ Sansure Biotech มีอัตราผลบวกที่ต่ำกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับ CRS (p < 0.05)การวิเคราะห์ของ Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) ของ PPA, NPA และข้อตกลงโดยรวมเกิน 93.5% โดยมีค่าความแข็งแกร่งของ Cohen Kappa ที่มูลค่าข้อตกลง 0.925 สุดท้ายนี้ Sansure Biotech Assay (RUO) จำเป็นต้องมีการตรวจสอบเพิ่มเติมสำหรับการใช้งานในเอธิโอเปีย และควรพิจารณาการวิจัยเพิ่มเติมเพื่อประเมินคำกล่าวอ้างจากผู้ผลิตแต่ละราย
การออกแบบการศึกษาเปรียบเทียบได้ดำเนินการที่สถานพยาบาลสี่แห่งในแอดดิสอาบาบา โรงพยาบาล Eka Kotebe ศูนย์บำบัดคริสตจักรมิลเลนเนียม โรงพยาบาล Zewooditu Memorial และโรงพยาบาลผู้เชี่ยวชาญวัณโรคเซนต์ปีเตอร์ ข้อมูลถูกรวบรวมระหว่างวันที่ 1 ถึง 31 ธันวาคม 2020 สถานพยาบาลสำหรับการศึกษานี้ได้รับการคัดเลือกอย่างตั้งใจโดยพิจารณาจากจำนวนผู้ป่วยที่สูงและความพร้อมของศูนย์บำบัดหลักๆ ในเมือง ในทำนองเดียวกัน เครื่องมือ ซึ่งรวมถึงเครื่องมือ PCR แบบเรียลไทม์ ABI 7500 และ Abbott m2000 ได้รับการคัดเลือกตามคำแนะนำของผู้ผลิตรีเอเจนต์ NAAT และเลือกชุดตรวจจับ PCR สี่ชุดสำหรับการศึกษานี้ เนื่องจากห้องปฏิบัติการส่วนใหญ่ในเอธิโอเปียใช้อย่างน้อยที่สุด สี่คน การทดสอบยีน, การทดสอบ SARS-CoV-2 ของ Abbott, การทดสอบ Sansure Biotech และการทดสอบ BGI ของ SARS-CoV-2 ที่ดำเนินการในระหว่างการศึกษา)
การทดสอบ SARS-CoV-2 ดำเนินการตั้งแต่วันที่ 1 ถึง 30 ธันวาคม 2020 โดยใช้ Viral Transport Medium (VTM) (VTM) (เทคโนโลยี Miraclean เซินเจิ้น จีน) ปริมาณ 3 มล. จากบุคคลที่อยู่ภายใต้การสอบสวนโรคโควิด-19 ซึ่งเรียกว่า EPHI ตัวอย่างโพรงจมูกถูกเก็บโดยผู้รวบรวมตัวอย่างที่ผ่านการฝึกอบรม และส่งไปยัง EPHI ในชุดสามชุด ก่อนที่จะมีการแยกกรดนิวคลีอิก แต่ละตัวอย่างจะได้รับหมายเลขประจำตัวที่ไม่ซ้ำกัน การสกัดจะดำเนินการจากแต่ละตัวอย่างทันทีเมื่อมาถึงโดยใช้วิธีการสกัดแบบแมนนวลและแบบอัตโนมัติ ดังนั้น สำหรับการสกัด Abbott m2000 โดยอัตโนมัติ ตัวอย่าง 1.3 มล. (รวมถึงปริมาตรที่ตายแล้ว 0.8 มล. และปริมาตรทางเข้าของการสกัด 0.5 มล.) จะถูกสกัดจากแต่ละตัวอย่างและผ่านระบบการเตรียมตัวอย่าง DNA ของ Abbott (Abbott Molecular Inc. des Plaines, อิลลินอยส์ สหรัฐอเมริกา) ) ชุดควบคุม 96 รายการ [92 ตัวอย่าง ตัวควบคุมการตรวจจับ 2 รายการ และตัวควบคุมที่ไม่ใช่เทมเพลต (NTC) 2 รายการ] รวมอยู่ในกระบวนการโดยรวม (การดึงและการตรวจจับ) ของ SARS-CoV-2 (EUA) สองรอบแบบเรียลไทม์ การทำเหมืองแร่ ในทำนองเดียวกัน สำหรับการสกัดด้วยตนเอง ให้ใช้ตัวอย่างเดียวกัน (สำหรับการสกัดและการค้นพบอัตโนมัติ) ดังนั้น ตลอดกระบวนการ ตัวอย่าง 140 ไมโครลิตรจึงได้รับการแบ่งส่วนและสกัดโดยใช้ชุดมินิคิท QIAamp Viral RNA (QIAGEN GmbH, ฮิลเดน, เยอรมนี) ในชุดละ 24 ตัวอย่าง (รวมถึงตัวอย่าง 20 ตัวอย่าง, ชุดควบคุมการตรวจวิเคราะห์สองชุด และ NTC สองชุด) ในเก้ารอบ สารชะที่สกัดด้วยตนเองจะถูกขยายและตรวจพบโดยใช้เครื่องหมุนเวียนความร้อน ABI 7500 โดยใช้การทดสอบ SARS-CoV-2 BGI, การทดสอบ Daan Gene และการทดสอบ Sansure Biotech
การแยกและการทำให้บริสุทธิ์ของ RNA ของไวรัส SARS-CoV-2 โดยอัตโนมัติเป็นไปตามหลักการเม็ดบีดแม่เหล็กโดยใช้รีเอเจนต์ในการเตรียมตัวอย่าง DNA ของ Abbott การปิดใช้งานตัวอย่างและการละลายอนุภาคไวรัสจะดำเนินการโดยใช้ผงซักฟอกที่มีไอโซไทโอไซยาเนตกัวนิดีนเพื่อทำลายธรรมชาติของโปรตีนและยับยั้ง RNase จากนั้น RNA จะถูกแยกออกจากโปรตีนโดยการแยกเฟสของแข็งโดยใช้ซิลิกา เช่น เกลือกัวนิดิเนียม และค่า pH ที่เป็นด่างของบัฟเฟอร์สลายสาร ส่งเสริมการจับตัวของกรดนิวคลีอิกกับซิลิกา (SiO2) ขั้นตอนการล้างจะกำจัดโปรตีนและเศษที่เหลือออกเพื่อให้ได้สารละลายที่ชัดเจน RNA โปร่งใสถูกแยกได้จากอนุภาคขนาดเล็กที่มีซิลิกาโดยใช้สนามแม่เหล็กของอุปกรณ์20,21 ในทางกลับกัน การแยก RNA ด้วยตนเองและการทำให้บริสุทธิ์ของ RNA ดำเนินการโดยวิธีสปินคอลัมน์โดยใช้การหมุนเหวี่ยงแทนการใช้ขาตั้งแม่เหล็กและการแยกอนุภาคขนาดเล็กออกจากตัวชะ
การทดสอบการตรวจจับ SARS-CoV-2 แบบเรียลไทม์ของ Abbott (Abbott Molecular, Inc.) ดำเนินการตามคำแนะนำของผู้ผลิต ซึ่งได้รับการ EUA19,22 จาก WHO และ FDA ในเกณฑ์วิธีนี้ ดำเนินการยุติการใช้งานตัวอย่างก่อนการสกัดในอ่างน้ำที่อุณหภูมิ 56 °C เป็นเวลา 30 นาที หลังจากการยับยั้งไวรัสแล้ว จะมีการสกัดกรดนิวคลีอิกในเครื่องมือ Abbott m2000 SP จาก VTM 0.5 มล. โดยใช้ระบบการเตรียมตัวอย่าง DNA ของ Abbott m2000 ตามที่ผู้ผลิตกำหนด การขยายและการตรวจจับดำเนินการโดยใช้เครื่องมือ Abbott m2000 RT-PCR และดำเนินการตรวจจับคู่สำหรับยีน RdRp และ N ROX) และ VIC P (สีย้อมที่เป็นกรรมสิทธิ์) สำหรับการกำหนดเป้าหมายและการตรวจจับการควบคุมภายใน ทำให้สามารถตรวจจับผลิตภัณฑ์แอมพลิฟายเออร์ทั้งสองพร้อมกันได้ 19
วิธีการตรวจจับการขยายเสียงของชุดอุปกรณ์นี้ใช้เทคโนโลยี RT-PCR ในขั้นตอนเดียว ยีน ORF1a/b และ N ได้รับเลือกให้เป็นพื้นที่อนุรักษ์โดย Daan Gene Technology เพื่อตรวจจับการขยายขอบเขตเป้าหมาย ไพรเมอร์เฉพาะและโพรบฟลูออเรสเซนต์ (โพรบยีน N ที่มีป้ายกำกับ FAM, โพรบ ORF1a/b ที่มีป้ายกำกับด้วย VIC) ได้รับการออกแบบมาเพื่อตรวจจับ SARS-CoV-2 RNA ในตัวอย่าง สารชะสุดท้ายและของผสมหลักถูกเตรียมโดยการเติมตัวชะ 5 ไมโครลิตรลงใน 20 ไมโครลิตรของของผสมหลักไปยังปริมาตรสุดท้ายที่ 25 ไมโครลิตร การขยายและการตรวจจับดำเนินการพร้อมกันบนอุปกรณ์ PCR แบบเรียลไทม์ ABI 750024
ตรวจพบยีน ORF1a/b และ N โดยใช้ชุดวินิจฉัยกรดนิวคลีอิกของ Sansure Biotech nCoV-2019 (การตรวจจับ PCR เรืองแสง) เตรียมโพรบเฉพาะสำหรับแต่ละยีนเป้าหมายโดยการเลือกช่อง FAM สำหรับบริเวณ ORF1a/b และช่อง ROX สำหรับยีน N ในชุดทดสอบนี้ จะมีการเพิ่มสารชะและรีเอเจนต์ผสมหลักดังนี้: เตรียมรีเอเจนต์ผสมหลัก 30 µl และตัวอย่างที่ถูกชะ 20 µl สำหรับการตรวจจับ/การขยาย PCR ABI 750025 แบบเรียลไทม์ใช้สำหรับการขยาย/การตรวจจับ
การทดสอบ SARS-CoV-2 BGI เป็นชุดตรวจ rRT-PCR แบบเรียลไทม์เรืองแสงสำหรับการวินิจฉัยโรคโควิด-19 ภูมิภาคเป้าหมายตั้งอยู่ในภูมิภาค ORF1a/b ของจีโนม SARS-CoV-2 ซึ่งเป็นวิธีการตรวจจับยีนเดี่ยว นอกจากนี้ ยีนดูแลทำความสะอาดของมนุษย์ β-actin ยังเป็นยีนเป้าหมายที่ได้รับการควบคุมภายใน ส่วนผสมหลักเตรียมโดยการผสมรีเอเจนต์ผสมหลัก 20 µl และตัวอย่าง RNA ที่สกัดแล้ว 10 µl ในจานหลุม26 เครื่องมือ PCR แบบเรียลไทม์เชิงปริมาณฟลูออเรสเซนต์ ABI 7500 ใช้สำหรับการขยายและการตรวจจับ การขยายกรดนิวคลีอิกทั้งหมด สภาวะการทำงานของ PCR สำหรับการสอบวิเคราะห์แต่ละครั้ง และการตีความผลลัพธ์ได้ดำเนินการตามคำแนะนำของผู้ผลิตที่เกี่ยวข้อง (ตารางที่ 3)
ในการวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบนี้ เราไม่ได้ใช้วิธีการมาตรฐานอ้างอิงเพื่อกำหนดเปอร์เซ็นต์ข้อตกลง (บวก ลบ และโดยรวม) และพารามิเตอร์การเปรียบเทียบอื่นๆ สำหรับการวิเคราะห์ทั้งสี่ครั้ง การเปรียบเทียบการทดสอบแต่ละครั้งเสร็จสิ้นด้วย CRS ในการศึกษานี้ CRS ถูกกำหนดโดยกฎ "ผลบวกใดๆ" และผลลัพธ์ถูกกำหนด ไม่ใช่โดยการทดสอบครั้งเดียว เราใช้ผลการทดสอบที่ตรงกันอย่างน้อยสองรายการ นอกจากนี้ ในกรณีของการแพร่เชื้อโควิด-19 ผลลบลวงมีอันตรายมากกว่าผลลบลวง ดังนั้น หากต้องการพูดว่า “เป็นบวก” อย่างถูกต้องที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้จากผลลัพธ์ CRS การทดสอบการทดสอบอย่างน้อยสองครั้งต้องเป็นค่าบวก ซึ่งหมายความว่าผลลัพธ์ที่เป็นบวกอย่างน้อยหนึ่งรายการน่าจะมาจากการทดสอบ EUA ดังนั้นจากผลการทดสอบสี่รายการ ผลการทดสอบสองรายการขึ้นไปที่ให้ผลลัพธ์เดียวกันจะถือว่าเป็นผลบวกหรือลบจริง18,27
ข้อมูลถูกเก็บรวบรวมโดยใช้แบบฟอร์มการแยกข้อมูลที่มีโครงสร้าง การป้อนข้อมูลและการวิเคราะห์ดำเนินการโดยใช้ซอฟต์แวร์ทางสถิติ Excel และ SPSS เวอร์ชัน 23.0 สำหรับสถิติเชิงพรรณนา มีการวิเคราะห์เปอร์เซ็นต์ข้อตกลงเชิงบวก ลบ และเปอร์เซ็นต์โดยรวม และใช้คะแนนแคปปาเพื่อกำหนดระดับข้อตกลงของแต่ละวิธีกับ CRS ค่าคัปปาถูกตีความดังนี้: 0.01 ถึง 0.20 สำหรับข้อตกลงเล็กน้อย, 0.21 ถึง 0.40 สำหรับข้อตกลงทั่วไป, 0.41-0.60 สำหรับข้อตกลงระดับปานกลาง, 0.61-0.80 สำหรับข้อตกลงหลักและ 0.81-0.99 สำหรับข้อตกลงที่สมบูรณ์28
ได้รับการอนุญาตด้านจริยธรรมจากมหาวิทยาลัยแอดดิสอาบาบา และโปรโตคอลการทดลองทั้งหมดสำหรับการศึกษานี้ได้รับการอนุมัติจากคณะกรรมการพิจารณาจริยธรรมทางวิทยาศาสตร์ของสถาบันสาธารณสุขเอธิโอเปีย หมายเลขอ้างอิงสำหรับใบอนุญาตจริยธรรม EPHI คือ EPHI/IRB-279-2020 ใช้วิธีการทั้งหมดตามคำแนะนำและบทบัญญัติของแนวทางที่ครอบคลุมแห่งชาติของเอธิโอเปียสำหรับการรักษาโควิด-19 นอกจากนี้ยังได้รับความยินยอมเป็นลายลักษณ์อักษรจากผู้เข้าร่วมการศึกษาทุกคนก่อนเข้าร่วมในการศึกษา
ข้อมูลทั้งหมดที่ได้รับหรือวิเคราะห์ในการศึกษานี้รวมอยู่ในบทความที่ตีพิมพ์นี้ ข้อมูลที่สนับสนุนผลการศึกษานี้มีให้จากผู้เขียนที่เกี่ยวข้องเมื่อมีการร้องขอที่สมเหตุสมผล
องค์การอนามัยโลก. คำแนะนำสำหรับกลยุทธ์การทดสอบในห้องปฏิบัติการสำหรับโรคโควิด-19: คำแนะนำชั่วคราว, 21 มีนาคม 2020 เลขที่ WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (WHO, 2020)
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 การวินิจฉัยอย่างชาญฉลาดในแผนกฉุกเฉิน: ในทางปฏิบัติทั้งหมด Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 การวินิจฉัยอย่างชาญฉลาดในแผนกฉุกเฉิน: ในทางปฏิบัติทั้งหมดMuliou, DS, Pantazopoulos, I. และ Gurgulianis, KI การวินิจฉัยอย่างชาญฉลาดของ COVID-19 ในแผนกฉุกเฉิน: ทุกอย่างในทางปฏิบัติMuliou DS, Pantazopoulos I. และ Gurgulyanis KI การวินิจฉัยอย่างชาญฉลาดของ COVID-19 ในแผนกฉุกเฉิน: การบูรณาการจากต้นทางถึงปลายทางในทางปฏิบัติ ผู้เชี่ยวชาญสาธุคุณหายใจ ยา. 3, 263–272 (2022)
Mitchell, SL และ St George, K. การประเมิน ID ของ COVID19 ตอนนี้การทดสอบ EUA Mitchell, SL และ St George, K. การประเมิน ID ของ COVID19 ตอนนี้การทดสอบ EUAMitchell, SL และ St. George, K. การประเมิน ID ของ COVID19 ตอนนี้การทดสอบ EUAMitchell SL และ St. George K. การประเมิน ID โควิด 19 ตอนนี้การทดสอบ EUA เจคลินิก. ไวรัส. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
WHO. การตรวจหาโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 (COVID-19) ในห้องปฏิบัติการที่ต้องสงสัยโรคในมนุษย์ https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (เข้าถึงเมื่อ 15 สิงหาคม 2563) (WHO, 2020).
Udugama, B. และคณะ การวินิจฉัยโรคโควิด-19: โรคและเครื่องมือทดสอบ เอซีเอสนาโน 14(4), 3822–3835 (2020)
ไซด เอส. และคณะ การจัดตั้งวิทยาลัยพยาธิวิทยาแห่งแอฟริกาตะวันออก กลางและใต้ - โรงเรียนพยาธิวิทยาระดับภูมิภาคของตะวันออกกลางและแอฟริกาใต้ แอฟริกา. เจ.แล็บ. ยา. 9(1), 1-8 (2020)
สถาบันสาธารณสุขแห่งเอธิโอเปีย กระทรวงสาธารณสุข ยุทธศาสตร์ชาติชั่วคราวและแนวทางการวินิจฉัยทางห้องปฏิบัติการโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (เข้าถึงเมื่อ 12 สิงหาคม 2020) (EPHI, 2020)
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS การทดสอบเชิงลบที่เป็นเท็จสำหรับความท้าทายและผลกระทบจากการติดเชื้อ SARS-CoV-2 Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS การทดสอบเชิงลบที่เป็นเท็จสำหรับความท้าทายและผลกระทบจากการติดเชื้อ SARS-CoV-2Voloshin S., Patel N. และ Kesselheim AS การทดสอบเชิงลบเชิงลบสำหรับการติดเชื้อ SARS-CoV-2 และผลที่ตามมาVoloshin S., Patel N. และ Kesselheim AS การทดสอบเชิงลบเชิงลบสำหรับการยั่วยุและผลกระทบของการติดเชื้อ SARS-CoV-2 เอ็นอังกฤษ เจ. แพทยศาสตร์. 383(6), e38 (2020)
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI กรณีผู้ป่วยโรคโควิด-19 เชิงบวกและลบลวง: กลยุทธ์การป้องกันและจัดการระบบทางเดินหายใจ การฉีดวัคซีน และมุมมองเพิ่มเติม Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI กรณีผู้ป่วยโรคโควิด-19 เชิงบวกและลบลวง: กลยุทธ์การป้องกันและจัดการระบบทางเดินหายใจ การฉีดวัคซีน และมุมมองเพิ่มเติม Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Моложноположительные и ложноотрицательные случаи COVID-19: респираторная профилактика и стратегии лечения, вакцинация и дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI กรณีผลบวกลวงและผลลบลวงของโควิด-19: กลยุทธ์การป้องกันและรักษาระบบทางเดินหายใจ การฉีดวัคซีน และหนทางข้างหน้าMuliu, DS และ Gurgulianis, KI กรณีผลบวกลวงและผลลบลวงของ COVID-19: กลยุทธ์ในการป้องกันและรักษาระบบทางเดินหายใจ การฉีดวัคซีน และหนทางข้างหน้า ผู้เชี่ยวชาญสาธุคุณหายใจ ยา. 15(8), 993–1002 (2021)
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. การวินิจฉัยโรค COVID-19 ในแผนกฉุกเฉิน: เห็นต้นไม้แต่สูญเสียป่า Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. การวินิจฉัยโรค COVID-19 ในแผนกฉุกเฉิน: เห็นต้นไม้แต่สูญเสียป่าMouliou, DS, Ioannis, P. และ Konstantinos, G. การวินิจฉัยโรคโควิด-19 ในแผนกฉุกเฉิน: เห็นต้นไม้ สูญเสียป่าMuliou DS, Ioannis P. และ Konstantinos G. การวินิจฉัยโรคโควิด-19 ในห้องฉุกเฉิน: ป่าไม่เพียงพอสำหรับต้นไม้ ปรากฏ. ยา. เจ https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022)
เดกลี-แองเจลี อี. และคณะ การตรวจสอบความถูกต้องและการตรวจสอบความถูกต้องของประสิทธิภาพเชิงวิเคราะห์และทางคลินิกของการทดสอบ SARS-CoV-2 แบบเรียลไทม์ของ Abbott เจคลินิก. ไวรัส. 129, 104474 https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020)
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. เปรียบเทียบชุดไพรเมอร์ห้าชุดจากภูมิภาคจีโนมที่แตกต่างกันของ COVID-19 สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อไวรัสโดย RT-PCR แบบธรรมดา Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. การเปรียบเทียบชุดไพรเมอร์ห้าชุดจากภูมิภาคจีโนมที่แตกต่างกันของ COVID-19 สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อไวรัสโดย RT-PCR แบบธรรมดาMollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. และ Aflatunyan, B. การเปรียบเทียบไพรเมอร์ห้าชุดจากภูมิภาคต่างๆ ของจีโนม COVID-19 สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อไวรัสโดย RT-PCR แบบธรรมดา Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. ความรู้เรื่องโควิด-19不同基因组区域的个引物组，用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. การเปรียบเทียบ 5 บริเวณทางพันธุกรรมที่แตกต่างกันของ COVID-19 สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อไวรัสโดย RT-PCR แบบธรรมดาMollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. และ Aflatunyan B. การเปรียบเทียบไพรเมอร์ห้าชุดจากภูมิภาคต่าง ๆ ของจีโนม COVID-19 สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อไวรัสโดย RT-PCR แบบธรรมดาอิหร่าน. เจ. จุลชีววิทยา. 12(3), 185 (2020).
Goertzer ฉันและคณะ ผลลัพธ์เบื้องต้นของโปรแกรมการประเมินคุณภาพภายนอกระดับชาติสำหรับการตรวจหาลำดับจีโนม SARS-CoV-2 เจคลินิก. ไวรัส. 129, 104537 https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020)
วัง ม. และคณะ การประเมินเชิงวิเคราะห์ประสิทธิภาพของชุด RT-PCR ห้าชุดสำหรับโรคทางเดินหายใจเฉียบพลันรุนแรงโคโรนาไวรัส 2. เจ. คลินิก ห้องปฏิบัติการ ทวารหนัก 35(1), e23643 (2021)
วังบี และคณะ การประเมินชุดตรวจจับ RNA ของ SARS-CoV-2 จำนวน 7 ชุดที่มีจำหน่ายทั่วไปในประเทศจีน โดยอิงจากปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส (PCR) แบบเรียลไทม์ ทางคลินิก เคมี. ห้องปฏิบัติการ ยา. 58(9), e149–e153 (2020)
แวน คาสเตเรน, PB และคณะ เปรียบเทียบชุดตรวจวินิจฉัยโรคโควิด-19 RT-PCR เชิงพาณิชย์จำนวน 7 ชุด เจคลินิก. ไวรัส. 128, 104412 (2020)
หลู หยู และคณะ การเปรียบเทียบประสิทธิภาพการวินิจฉัยของชุด PCR สองชุดสำหรับการตรวจหากรดนิวคลีอิก SARS-CoV-2 เจคลินิก. ห้องปฏิบัติการ ทวารหนัก 34(10), e23554 (2020)
เลฟาร์ต พีอาร์ ฯลฯ การศึกษาเปรียบเทียบแพลตฟอร์มการทดสอบการขยายกรดนิวคลีอิก (NAAT) ของ SARS-CoV-2 จำนวน 4 แพลตฟอร์ม แสดงให้เห็นว่าประสิทธิภาพของ ID NOW ลดลงอย่างมีนัยสำคัญ โดยขึ้นอยู่กับผู้ป่วยและประเภทตัวอย่าง การวินิจฉัย จุลชีววิทยา ติดเชื้อ ดิส 99(1), 115200 (2021)
โมเลกุลของแอ๊บบอต แพ็คเกจการวิเคราะห์ SARS-CoV-2 แบบเรียลไทม์ของ Abbott https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay 1-12. (ณ วันที่ 10 สิงหาคม 2563) (2563).
ไคลน์, เอส. และคณะ. การแยก RNA ของ SARS-CoV-2 โดยใช้เม็ดแม่เหล็กสำหรับการตรวจจับขนาดใหญ่อย่างรวดเร็วโดย RT-qPCR และ RT-LAMP ไวรัส 12(8), 863 (2020).